工程预算增加工程是“猫腻”较多的地方，究其原因，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。有些承包商在“低价中标法”中不计成本得到工程后，为了弥补损失，千方百计增加工程签证，在利益诱惑下，某些项目管理者乱签证、补签证现象严重 ，审计人员一旦认真复核，通常会发现签证工程量与实际出入较大。安装、装饰及园林工程结算取定的材料单价和市场行情出入很大，有的甚至“偷梁换柱”。例如某国产灯具安装材料套用进口材料价格，工地现场的名贵树种规格和结算书的规格大相径庭，通过现场勘查取证 ，工程预算水分被大大挤压出来。
施工组织设计的工程预算编制依据
(1)计划文件，包括 批准的基本建设计划文件、单位工程项目一览表、分期分批投产的要求、投资指标和设备材料订货指标、建设地点所在地区主管部门的批件、施工单位主管上级下达的施工任务等；
(2)设计文件，包括批准的初步设计或技术设计、设计说明书、总概算或修正总概算、可行性研究报告；
(3)合同文件，即施工单位与建设单位签订的工程承包合同；
(4)建设地区的调查资料，包括气象、地形、地质和其他地区性条件等结算过程其他注意事项结算的工程量以竣工图为准，竣工图不清之处，预算人员要得到工程管理中心的确认或到工地现场进行实地测量；尤其对图纸未标注、规范无特别要求，现场实际施工又提高标准的项目一定要有现场工程师文件确认并符合工程合同要求后才能给予按实结算。
工程审计是控制工程预算的有效措施，它可以提高工程资金的使用效率，对整个工程项目起到了监督检查的作用。随着经济的快速发展，我国开展的大型工程也相应的增多，工程项目审计在工程建设经济活动中起了越来越重要的作用。我国在工程审计中也相应地借鉴了国外的一些先进的技术，通过科学有效的创新管理，不断的丰富工程审计的项目和类型，推动了我国工程建设方面的重大发展。接下来我们具体讨论工程审计在工程预算控制中的有效作用。
编制标底应以设计图纸为依据，标底价格及工期的计算应执行 或地区所颁发的概(预)算定额和有关规定。人工、机械、台班及材料价格的变动因素，施工不可预见费或包干系数以及工程需要增加的措施费等应列标底；标底是否正确首先取决工程量表是否正确，因而在工程量表中要尽量减少漏项，并尽可能计算无误，力争计算工程量的误差控制在实际工程量的±5%以内，以防止加漏项和工程量差别太大而引起的索赔；标底是由主业主组织专门人员为准备招标的那一部分工程或设备，或工程和设备都有而计算出的一个合理的基本价格。大庆工程预算它不等于工程(或设备)的概预算，也不等于合同价格。标底是招标单位的绝密资料，不能向任何元关人员泄漏。我国国内大部分工程在招标评标时，均以标底上下的一个幅度(5%-10%)为判断投标是否合格的条件。标底一般是以概预算为基础编制的，标底价:包括招标工程总预算，单元预算，钢材、木材、水泥总用量及其单方用量，其中没有三材指标而需要议价采购的应注明其数量、单位价差及差价总金额，招标工程总预算中的所含各项费用的说明，包括包干系数或不可预见费用的说明和工程特殊技术措施费的说明。